【2026年版】クリニックにおすすめの決済端末3選｜医療機関向け特別手数料1.30%〜を徹底比較

「クリニックに導入する決済端末は、どの会社が一番お得なのか？」

「医療機関なら、通常の店舗よりクレジットカード手数料が安くなるの？」

クリニックや歯科医院でキャッシュレス決済を導入する際、このような疑問を持つ方は多いのではないでしょうか。

実は、決済会社によっては クリニック・診療所向けの特別な決済手数料が用意されています。

一般店舗向けの料率と比較すると、決済手数料が大きく下がる場合があります。

この記事では、現役の決済端末営業の視点から、医療機関向け特別料率を公式に案内している STORES 決済・stera pack・USEN PAY の3社を厳選して紹介します。

月額料金・端末費用・サポート体制・対象となるクリニックの種類まで比較するので、導入前の参考にしてください。

結論｜医療機関向けの優遇料率なら3社を比較

STORES 決済：1.30%〜
対象カードブランドが幅広く、手数料を最優先するクリニックに。
stera pack for クリニック：1.50%
Visa・Mastercardの低料率とプリンター内蔵端末を重視する医院に。
USEN PAY：1.90%〜
導入時や運用中のサポート体制を重視する医療機関に。

最低料率の比較ではSTORESが有力ですが、実際に適用されるブランド・条件によって有利なサービスは変わります。

クリニックにおすすめの決済端末3社を比較
医療特別料率で年間の決済コストはどれくらい変わる？
【1位】STORES 決済｜医療特別料率1.30%〜
【2位】stera pack for クリニック｜医療特別料率1.50%
【3位】USEN PAY｜医療機関向け手数料1.90%〜
医療特別料率はどんなクリニックでも使える？
クリニックが決済端末を選ぶときの4つのポイント
結局、どのクリニックにどの決済端末がおすすめ？
クリニックの決済端末でよくある質問
まとめ｜クリニックは医療特別料率がある3社から比較しよう
1. 参考資料・公式情報

クリニックにおすすめの決済端末3社を比較

医療機関・クリニック専用の優遇料率を提供している会社だけを比較します。

比較項目	1位 STORES 決済	2位 stera pack	3位 USEN PAY
医療特別料率	1.30%〜	1.50%	1.90%〜
主な対象決済	対象カード6ブランド・QUICPay	Visa・Mastercard	Visa・Mastercardほかブランドごとに審査
初期費用・端末	0円〜端末無償貸出はプラン条件あり	初期費用・端末代0円	対象条件により端末0円レンタル
月額費用	0円〜選択プランによる	3,300円（税込）	0円になる条件あり
レシート印刷	端末の種類による	プリンター内蔵	USEN PAYは内蔵
特徴	医療特別料率の対象ブランドが広い	2画面式・ロール紙無料・24時間受付	全国の拠点によるサポート
公式サイト	公式サイトはこちら>>	公式サイトはこちら>>	公式サイトはこちら>>

※2026年11月確認の公式公開情報に基づきます。
※各社の最低料率が、すべての決済ブランド・診療科目に適用されるわけではありません。
※医療特別料率は、通常の中小企業向けプランと適用条件が異なります。

医療特別料率の申込みには注意

必ず「医療機関向け特別料率」を希望することを伝え、対象業種・審査条件を確認してください。

医療特別料率で年間の決済コストはどれくらい変わる？

クリニックでは、保険診療・検査・自由診療などでカード決済が発生します。

月間カード決済額が大きくなるほど、手数料率の差が経営に影響します。

例えば、月間カード決済額が100万円だった場合、手数料は次のようになります。

仮定の料率	月間手数料	年間手数料
通常料率3.24%	32,400円	388,800円
USEN PAY 1.90%	19,000円	228,000円
stera pack 1.50%	15,000円	180,000円
STORES 1.30%	13,000円	156,000円

※同じ対象カード決済が毎月100万円あり、全取引に同一の料率が適用されると仮定した単純な計算例です。月額費用・振込手数料・消費税等は含みません。実際の適用料率を保証するものではありません。

通常3.24%と1.30%では年間232,800円の差

カード決済額が月100万円なら、料率が1.94ポイント違うだけで年間約23万円の負担差が生まれます。

ただし、有料プランの月額料金を含めると順位が変わる可能性もあります。 最低料率だけでなく年間総額で比較 することが重要です。

【1位】STORES 決済｜医療特別料率1.30%〜

手数料重視のクリニックに

STORES 決済

対象となる医療機関なら、主要カード決済を1.30%〜で利用できます。

医療特別料率 1.30%〜

対象カード 主要6ブランド

QUICPay 1.30%〜

初期費用・固定費 0円〜

2026年4月から医療特別料率を拡充

STORES 決済は2026年4月1日から、対象医療機関向けの特別料率を拡充しました。

対象となる医療機関では、以下のクレジットカード6ブランドと QUICPayの決済手数料が1.30%〜となります。

Visa
Mastercard
JCB
American Express
Diners Club
Discover
QUICPay

Visa・Mastercardだけでなく、幅広いクレジットカードブランドで優遇料率が案内されている点が魅力です。

対象となるクリニック

STORES公式では、医療法に定める病院・診療所のうち、対象業種として次のような診療科目を案内しています。

内科
外科・形成外科
皮膚科
眼科
歯科
その他の対象となる単科病院・診療所

動物病院は対象外

注意したいのが、対象外となる医療業種です。

STORESは医療特別料率の対象外として、 動物病院・薬局・総合病院・大学病院などを挙げています。

特に、皮膚科と美容クリニック、形成外科と美容医療を扱う施設などは、事業内容によって判断が異なる可能性があるため、申込前の確認が必要です。

医療特別料率は専用の申込経路を確認

STORESの通常サービスへの申込みと医療特別料率の申込みでは、案内される手続きが異なる場合があります。

STORES公式の医療特別料率ページで対象条件を確認してください。

こんなクリニックにおすすめ

クレジットカード手数料を抑えたい
Visa以外のカード利用も多い
固定費を抑えた導入を検討している
オンライン診療などの決済も検討したい

公式サイトはこちら>> STORES 決済のサービス・導入条件を確認

【2位】stera pack for クリニック｜医療特別料率1.50%

端末性能・サポートも重視

stera pack for クリニック

医療機関専用のサブスクリプション型キャッシュレス決済サービスです。

Visa・Mastercard 1.50%

端末初期費用 0円

月額費用 3,300円（税込）

ロール紙・通常修理 無料 ※条件あり

Visa・Mastercardが1.50%

stera pack for クリニックは、医療機関向けに用意された専用の料金プランです。

公式サイトでは、 Visa・Mastercardの対面決済手数料を 1.50%と案内しています。

JCB・American Expressなどその他のカードブランドの料率は、申込時に個別確認が必要です。

受付業務との相性がよい2画面式端末

stera terminal standardには、患者側とスタッフ側の 2つの操作画面が備わっています。

端末の向きを変えずに暗証番号の入力や会計を進めやすく、受付窓口での利用に向いています。

レシートプリンターも内蔵されており、ロール紙の追加費用もかかりません。

24時間365日の受付サポート

stera packは、 24時間365日受付のヘルプデスクや、所定条件での端末修理・交換に対応しています。

スタッフが複数人で決済端末を利用するクリニックでは、サポート体制も重要です。

注意点は月額料金と契約期間

医療機関向けプランの月額利用料は 3,300円（税込）です。

通常のstera packで案内される初年度無料などの条件と、医療機関向けプランの条件を混同しないようにしましょう。

契約期間は3年間で、解約時には端末返却などの条件があります。

stera packにはクリニック専用ページがあります

一般向けプランと手数料・月額費用が異なるため、申込み前に専用プランの内容を確認してください。

stera pack for クリニック公式案内

こんなクリニックにおすすめ

Visa・Mastercardの決済が多い
2画面式の端末を使いたい
ロール紙代などを抑えたい
サポート体制を重視したい

公式サイトはこちら>> stera packのサービス・医療プラン条件を確認

【3位】USEN PAY｜医療機関向け手数料1.90%〜

導入後のサポートも重視

USEN PAY

医療機関向けの特別料率と導入・保守サポートを提供しています。

医療機関向け料率 1.90%〜

端末費用 条件により0円

月額費用 条件により0円

サポート 電話・全国拠点

医療機関向けの特別料率がある

USEN PAYは、医療機関向けのカード決済手数料として 1.90%〜を案内しています。

対象となる業種には、一般診療所やクリニック、歯科診療所、メンタルクリニックなどが含まれています。

ただし、Visa・Mastercardと JCB・QUICPayでは対象業種が異なり、各ブランドの審査結果によって適用可否が決まります。

導入前後のサポートが特徴

USEN PAYでは、導入時の相談や設定案内に加え、運用中の電話サポートや全国の拠点を活用した保守対応を案内しています。

決済端末に詳しいスタッフがいないクリニックでは、相談先があることは安心材料の一つです。

決済端末をまとめて導入できる

USEN PAYは、カード・電子マネー・ QRコード決済に対応する端末を提供しています。

対象条件によっては端末費用や月額料金を抑えられる場合もあります。

医療料率の適用には別途審査が必要

医療機関なら必ず1.90%になるわけではありません。診療科目・カードブランド・加盟店審査により料率が変わる可能性があります。

USEN PAY公式の医療機関向け料率を確認

こんなクリニックにおすすめ

キャッシュレス決済を初めて導入する
導入後のサポートを重視したい
カード以外の決済もまとめたい
端末の保守対応を重視したい

公式サイトはこちら>> USEN PAYの料金・医療機関向け条件を確認

医療特別料率はどんなクリニックでも使える？

クリニック向けの優遇手数料を比較する際に、必ず確認しておきたいのが対象業種です。

保険診療を行う一般的な診療所

内科・外科・眼科・歯科などの一般診療所は、今回紹介した医療機関向けプランの比較候補になります。

ただし、診療内容や業態によって対象外となる場合があります。

美容クリニック・美容皮膚科

美容医療を主として提供する施設では、医療特別料率が適用されない場合があります。

特にSTORES 決済では、美容クリニックが対象外として明記されています。

自由診療の割合や主たる事業内容などにより、取り扱いが異なる可能性があるため、必ず申込先へ確認しましょう。

整骨院・接骨院・鍼灸院

整骨院・接骨院・鍼灸院は、医師または歯科医師が診療を行う一般的なクリニックと同じ区分にはならない場合があります。

なおSTORESでは、これらの業種向けに別の業種特別料率も用意されています。

動物病院・薬局

動物病院や調剤薬局についても、通常のクリニック向け医療特別料率と同じ扱いとは限りません。

STORESでは医療特別料率の対象外と明記されています。

申し込み前の確認ポイント

自院の診療科目が特別料率の対象か
保険診療と自由診療の取り扱い
適用されるカードブランド
別途審査や書類提出が必要か

クリニックが決済端末を選ぶときの4つのポイント

① 医療特別料率が適用される決済ブランド

最安料率が1.30%でも、患者が利用するカードの大半に適用されなければ、期待したほどの費用削減につながりません。

Visa・Mastercardだけでなく、 JCBなどの利用割合も確認しましょう。

② 月額料金と年間手数料の総額

手数料だけでなく、月額サービス利用料、端末代、振込手数料なども加えて比較することが重要です。

例えば、月額3,300円のサービスなら、年間固定費は39,600円です。

③ 受付スタッフの操作性

医療機関では、会計だけでなく電話対応や次回予約など、受付スタッフの業務が多岐にわたります。

端末の操作画面やレシート印刷方法、現在のレセコンやPOSとの連携可否も確認しましょう。

④ 入金サイクルとサポート体制

入金タイミングは資金繰りに関係します。また、端末故障時にどのようなサポートを受けられるかも重要です。

毎月の決済額が大きい医療機関ほど、手数料とあわせて確認してください。

結局、どのクリニックにどの決済端末がおすすめ？

重視すること	おすすめ候補
医療向け手数料の低さ	STORES 決済
Visa・Mastercardの低料率	stera pack for クリニック
プリンター内蔵・2画面端末	stera pack
導入・保守サポート	USEN PAY
幅広いカードブランドの医療優遇	STORES 決済